1、贷款利率不同;2、贷款机构主体不同;3、贷款的资金来源不同;4、贷款对象不同;5、贷款手续不同;6、还款方式不同;7、所需要费用不同。相较于商贷，公积金比较划算。“商业贷款”向银行提出申请，由银行放款，按照与银行约定的利率执行;“公积金贷款”可以向合作银行提出申请，也可以向公积金管理中心直接提出申请，由公积金管理中心放款，按照与公积金管理中心约定的利率执行。
法律依据：《住房公积金管理条例》
职工有下列情形之一的，可以提取住房公积金账户内的存储余额：
1、购买、建造、翻建、大修自住住房的;
2、离休、退休的;
3、完全丧失劳动能力，并与单位终止劳动关系的;
4、出境定居的;
5、偿还自住住房贷款本息的;
6、租房自住的;(职工本人及配偶在北京市无自有住房且租住公共租赁住房或商品房，可提取夫妻双方住房公积金支付房租。)
7、生活困难，正在领取城镇最低生活保障金的;
8、遇到突发事件，造成家庭生活严重困难的;
9、进城务工人员，与单位解除劳动关系的;
10、在职期间判处死刑、判处无期徒刑或有期徒刑刑期期满达到国家法定退休年龄的;
11、死亡或者被宣告死亡的;
职工符合本办法第四条1、5、6、7、8情形提取住房公积金的，配偶可以同时提取本人账户内的住房公积金。
