不会自动注销，但有一定的影响。
1、进入工商黑名单
如果营业执照一年不审，工商局就会自动吊销执照，并将法人和股东例为非正常黑名单。三年内不能担任企业法人。
2、税务稽查完税情况
如果公司有营业额，但在税务部门没有完税凭证，有欠缴的应缴税款，则会产生滞纳金，目前标准是每天万分之五。
3、银行开立的公司专户，每年要审，并要交纳管理费，如果不注销，银行可能将法人纳入征信黑名单，对法人的信用评级产生影响，对经后货款买车、买房或办理出国移民，有一定影响。
【法律依据】
根据《公司法》第188条规定：公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
