分居两年了，男方不同意离婚，我该怎么办

事实上不管分居多久也不论分居的原因是什么，有效婚姻都不会因此而自动解除。在分居满两年而男方又不愿意离婚的情况下，可以向人民法院提起离婚诉讼。一般情况下，因感情不和分居满两年的，法院应先进行调解；调解不成的，将作出离婚判决。 
《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条【协议离婚】夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。