当借款合同发生纠纷时，当事人双方首先应及时协商解决。因为协商解决有利于维护双方的感情，有利于以后继续合作，而且协商解决简便、迅速、耗费少、便于执行，因而是一种常用方法。
如果当事人协商不成，任何一方均可向合同管理机构申请调解、仲裁，也可以直接向人民法院起诉。在利用诉讼方式解决纠纷时，法院一定要及时、正确地审理案件，解决纠纷，不要久拖不决，以减少双方当事人的经济损失，维护国家、社会和公民个人的利益。根据《民事诉讼法》的规定，解决借款合同的纠纷有一定期限限制。其期限适用《民法总则》（自2021年1月1日起废止）关于一般诉讼时效的规定，即从知道或应当知道权利被侵害之日起三年不向法院请求保护民事权利的，人民法院不予保护其权利。因此，合同当事人，特别是贷款人在借款合同发生纠纷后，要及时解决，不要超过时效限制，使自己丧失胜诉权，从而遭受经济损失。
《民法典》第五百三十三条合同成立后，合同的基础条件发生了当事人在订立合同时无法预见的、不属于商业风险的重大变化，继续履行合同对于当事人一方明显不公平的，受不利影响的当事人可以与对方重新协商；在合理期限内协商不成的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构变更或者解除合同。
