股東不同意公司合併怎麼處理

依照公司法的規定，對公司合併投反對票的股東可以選擇依照最終的決議，參與公司合併。另外，對公司合併決議持異議的股東有權要求公司以合理價格收購其股份。
【法律依據】《中華人民共和國公司法》第四十四條規定：股東會的議事方式和表決程序，除本法有規定的外，由公司章程規定。股東會會議作出修改公司章程、增加或者減少註冊資本的決議，以及公司合併、分立、解散或者變更公司形式的決議，必須經代表三分之二以上表決權的股東透過。