有兩個孩子法院會根據子女利益和雙方具體情況進行撫養權的判決。如果孩子還處於哺乳期有較大的可能性會將撫養權判給母親，如果孩子過了哺乳期則根據誰的綜合條件更有利於孩子健康成長判決。
【法律依據】《民法典》第一千零八十四條：父母與子女間的關係，不因父母離婚而消除。離婚後，子女無論由父或者母直接撫養，仍是父母雙方的子女。離婚後，父母對於子女仍有撫養、教育、保護的權利和義務。離婚後，不滿兩週歲的子女，以由母親直接撫養為原則。已滿兩週歲的子女，父母雙方對撫養問題協議不成的，由人民法院根據雙方的具體情況，按照最有利於未成年子女的原則判決。子女已滿八週歲的，應當尊重其真實意願。
