1、犯破坏计算机信息系统罪的，一般判处五年以下有期徒刑或拘役；
2、因其行为造成了特别严重后果的，则应判处五年以上有期徒刑；
3、如果单位犯本罪则对其判处罚金，并对其直接责任人员判处本罪个人犯相应的刑罚。法律依据：《刑法》第二百八十六条
违反国家规定，对计算机信息系统功能进行删除、修改、增加、干扰，造成计算机信息系统不能正常运行，后果严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处五年以上有期徒刑。
违反国家规定，对计算机信息系统中存储、处理或者传输的数据和应用程序进行删除、修改、增加的操作，后果严重的，依照前款的规定处罚。
故意制作、传播计算机病毒等破坏性程序，影响计算机系统正常运行，后果严重的，依照第一款的规定处罚。
单位犯前三款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照第一款的规定处罚。
