不能的。因为厂房是归属于公司所有的，即便是公司没有按照法律规定给与员工赔偿，员工也没有权利私下出售公司的厂房，而且厂房的出售是需要有产权的，员工没有相应的产权，自然也无法出售。
法律依据:《中华人民共和国城市房地产管理法》第三十八条下列房地产，不得转让：
（一）以出让方式取得土地使用权的，不符合本法第三十九条规定的条件的；
（二）司法机关和行政机关依法裁定、决定查封或者以其他形式限制房地产权利的；
（三）依法收回土地使用权的；
（四）共有房地产，未经其他共有人书面同意的；
（五）权属有争议的；
（六）未依法登记领取权属证书的；
（七）法律、行政法规规定禁止转让的其他情形。
