（一）本罪与非罪的界限
《刑法》第三百四十九条对本罪没有“数额”和“情节严重”的具体规定，从原则上说，窝藏、转移、隐瞒毒品、毒赃的行为都可构成犯罪，但司法实践中，要综合全案情况，具体分析，不能把一切窝藏、转移、隐瞒的行为都认定为犯罪，如果窝藏、转移、隐瞒毒品、毒赃的数量很小，又是初犯、偶犯等，主观恶性较小，一般不作为犯罪处罚。
（二）本罪与窝赃罪的界限
窝赃罪是指明知是犯罪所得的赃款而予以窝藏的行为。本罪保留了窝赃罪的基本性质，所不同的是，本罪的对象是特定的，仅限于毒品和毒赃。而窝赃罪的对象的范围广泛，包括除毒品犯罪以外的所有的刑事犯罪所得的赃款、赃物。其次，本罪的法定刑要比窝赃罪的法定刑高，体现了从严打击毒品犯罪的目的。
（三）本罪与非法持有毒品罪的界限
1、犯罪动机不同。非法持有毒品罪的主观故意是明知是毒品而非法持有。窝藏、转移、隐瞒毒品、毒赃罪的主观故意是故意为毒品犯罪分子窝藏、转移、隐瞒毒品、毒赃，达到逃避司法机关法律制裁的目的。
2、窝藏、转移、隐瞒毒品、毒赃罪没有数额规定。而非法持有毒品罪规定了数额。
窝藏、转移、隐瞒毒品的犯罪分子主要为毒品罪犯窝藏、转移、隐瞒毒品，当然必须先有非法持有毒品的行为，对此，我们认为，如窝藏、转移、隐瞒毒品犯罪人持有的毒品数量达到追究非法持有毒品罪数量的，应以非法持有毒品罪处罚、未达到数量的，可认定为本罪。
