补发工资应按照工资、薪金所得项目计征个人所得税。根据有关规定，调资后补发以前数月的工资，可以分推到所属月份，与原来的月工资合并计算应缴个人所得税。扣除已缴纳的个人所得税，即为应该补缴的税款。
法律依据：中华人民共和国个人所得税法 第十一条
居民个人取得综合所得，按年计算个人所得税;有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款;需要办理汇算清缴的，应当在取得所得的次年三月一日至六月三十日内办理汇算清缴。预扣预缴办法由国务院税务主管部门制定。居民个人向扣缴义务人提供专项附加扣除信息的，扣缴义务人按月预扣预缴税款时应当按照规定予以扣除，不得拒绝。非居民个人取得工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得和特许权使用费所得，有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次代扣代缴税款，不办理汇算清缴。
