有工資。
曠工三天自動離職流程：
1、員工按照公司的規定自動辦理離職手續，若是給用人單位造成損失的，用人單位可基於法律規定要求勞動者賠償損失。
2、用人單位方在確認員工未按規定履行請假手續而擅自離崗且無正當理由的，用人單位基於勞動者這一事實行爲作出解除勞動合同的決定的，則需進行以下流程：
（1）應透過各種渠道聯繫員工上班，如準備通知信寄往員工的任何地址，保留簽收證據，最好使用掛號信。
（2）結清員工工資，並辦理好社保手續。
（3）保留好員工所有的檔案及相關資料，如完備的考勤表。
法律依據《勞動合同法》。
